完善益生菌类保健食品检验与评价技术规范，研究益生菌纳入保健食品原料目录，规范益生菌类保健食品功能声称。

在食品加工用菌种质量要求方面，制定发布了《酵母产品分类导则》《酵母产品质量要求 第1部分：食品加工用酵母》和《酿酒酵母和乳酸克鲁维酵母的鉴定方法》等推荐性食品质量国家标准，在已有食品安全国家标准的基础上，对基础、质量指标、检测方法等作出规定，为食品加工用菌种高质量发展提供技术支撑。

指导地方市场监管部门依据国家卫生健康委发布的《关于〈可用于食品的菌种名单〉和〈可用于婴幼儿食品的菌种名单〉更新的公告》，规范食品加工用菌种及其制剂的生产许可，并督促企业规范标示菌种及其制剂名称。为规范相关食品标签标识，在新编写的《食品生产许可审查通则（2022版）》条款释义中以申请“益生菌菌粉”生产许可为案例进行了说明。

近年来，市场监管总局落实食品安全“四个最严”要求，采取综合措施，持续加大对包括利用益生菌虚假宣传在内的食品安全违法行为的打击力度，以坚决的行动保障人民群众“舌尖上的安全”。